精选理由
肿瘤基因组学研究者终于有了可复现的耐药预测基准——OncoTraj 直接点出当前单点NGS的模态瓶颈，做纵向建模或液体活检分析的团队值得关注，v2 的 ctDNA 设计方向会直接影响你的实验方案。
OncoTraj 是一个针对EGFR突变非小细胞肺癌（NSCLC）患者接受一线奥希替尼治疗后耐药预测的公开基准数据集，整合了来自MSK-CHORD、AACR Project GENIE BPC NSCLC和FLAURA研究的813例患者数据。该基准定义了三个任务：12个月进展二分类、进展时间回归和耐药机制六分类。当前v1版本仅使用单时间点组织NGS特征，所有模型（包括LSTM和多任务Transformer）在干净评估中均未超越随机水平，表明瓶颈在于输入模态而非算法。基准确认了TP53共突变与12个月进展率从29%升至59%的关联。OncoTraj为纵向耐药预测提供了可复现的基线，并明确了v2版本需引入连续ctDNA数据的设计方向。
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OncoTraj 是一个针对EGFR突变非小细胞肺癌（NSCLC）患者接受一线奥希替尼治疗后耐药预测的公开基准数据集，整合了来自MSK-CHORD、AACR Project GENIE BPC NSCLC和FLAURA研究的813例患者数据。该基准定义了三个任务：12个月进展二分类、进展时间回归和耐药机制六分类。当前v1版本仅使用单时间点组织NGS特征，所有模型（包括LSTM和多任务Transformer）在干净评估中均未超越随机水平，表明瓶颈在于输入模态而非算法。基准确认了TP53共突变与12个月进展率从29%升至59%的关联。OncoTraj为纵向耐药预测提供了可复现的基线，并明确了v2版本需引入连续ctDNA数据的设计方向。
Resistance to first-line osimertinib in EGFR-mutant non-small-cell lung cancer (NSCLC) is the canonical example of predictable clonal evolution under therapeutic pressure, yet no public benchmark exists for training or e…