精选理由
这篇论文用一个改进的损失函数让药物相互作用预测准了将近20个百分点,读来很有启发。
论文提出ClinicalFocal损失函数,集成到关系感知图卷积网络(RGCN)中,用于预测药物-药物相互作用。在TWOSIDES数据集上,五折交叉验证下,该方法将准确率从0.699提升至0.892(+19.3个百分点),F1分数从0.700提升至0.894。AUROC从0.766升至0.914,AUCPR从0.714升至0.860。假阴性率从29.8%降至9.1%,特异性从69.6%增至87.5%,整体分类错误降低64.1%。
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论文提出ClinicalFocal损失函数,集成到关系感知图卷积网络(RGCN)中,用于预测药物-药物相互作用。在TWOSIDES数据集上,五折交叉验证下,该方法将准确率从0.699提升至0.892(+19.3个百分点),F1分数从0.700提升至0.894。AUROC从0.766升至0.914,AUCPR从0.714升至0.860。假阴性率从29.8%降至9.1%,特异性从69.6%增至87.5%,整体分类错误降低64.1%。
Background: Graph neural networks improve computational prediction of polypharmacy side effects, but standard binary cross-entropy training allocates equal capacity to well-classified and difficult examples, potentially …