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非小细胞肺癌

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6月10日
10:52
10:52官方账号arXiv cs.LG@Abhijoy Sarkar, Aarchi Singh Thakur
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OncoTraj 是一个针对EGFR突变非小细胞肺癌(NSCLC)患者接受一线奥希替尼治疗后耐药预测的公开基准数据集,整合了来自MSK-CHORD、AACR Project GENIE BPC NSCLC和FLAURA研究的813例患者数据。该基准定义了三个任务:12个月进展二分类、进展时间回归和耐药机制六分类。当前v1版本仅使用单时间点组织NGS特征,所有模型(包括LSTM和多任务Transformer)在干净评估中均未超越随机水平,表明瓶颈在于输入模态而非算法。基准确认了TP53共突变与12个月进展率从29%升至59%的关联。OncoTraj为纵向耐药预测提供了可复现的基线,并明确了v2版本需引入连续ctDNA数据的设计方向。
论文基准数据集耐药预测EGFR突变非小细胞肺癌奥希替尼

推荐理由:肿瘤基因组学研究者终于有了可复现的耐药预测基准——OncoTraj 直接点出当前单点NGS的模态瓶颈,做纵向建模或液体活检分析的团队值得关注,v2 的 ctDNA 设计方向会直接影响你的实验方案。
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