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MetaboLLM-GIN

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8月7日
10:03
10:03官方账号arXiv cs.LG@Dohyun Ku, Min Gu Kwak, Francisco J. Pasquel, Jing Li
研究团队提出代谢组学专用大模型MetaboLLM,通过持续预训练、监督微调和结构化检索整合生化知识。配套的MetaboLLM-GIN将生成描述转换为代谢物图,用于患者级预测。在四个骨干模型家族上,MetaboLLM在代谢组学知识、关系和描述任务上优于对应基础模型和医学适配模型。MetaboLLM-GIN在冠状动脉搭桥术后应激性高血糖预测中AUC达0.8616,在绝经后激素方案分类中AUC为0.8123,超过传统模型和替代图构建方法。模型解释还产生了具有生物学意义的发现。
论文MetaboLLMMetaboLLM-GIN代谢组学

推荐理由:做代谢组学或临床预测的可以看看,MetaboLLM把生化知识变成图谱,两个预测任务的AUC都挺能打。
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