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官方账号arXiv cs.LG@Yiming Qin, Kai Yi, Miruna Cretu, Sjors H. W. Scheres, Pietro Liò, Pascal Frossard
推荐理由：这篇论文教你用AlphaFold-3和Boltz-2做药物分子设计，DBMol能自动生成高亲和力小分子，比无条件生成覆盖更多蛋白口袋。
DBMol
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7月22日
11:36
DBMol是一个新框架，利用AlphaFold-3和Boltz-2等结构预测模型指导小分子从头设计。它通过交替优化与投影过程：先基于Boltz-2进行梯度优化提升预测结合亲和力，再用流匹配模型将分子图映射为离散化学有效分子。实验表明DBMol能有效优化Boltz-2亲和力代理，生成分子在Boltz-2评估中具有强预测亲和力和特异性。在AF3等留出指标上，DBMol提升了口袋覆盖率并保持分子多样性，且无需参考配体监督。